衛生環境研究所では、タミフル耐性ウイルスの出現を監視するため、定期的にタミフル耐性遺伝子の確認検査を実施しています。タミフル耐性ウイルスと変異するのは、主にA2009型とAソ連型のインフルエンザウイルスで、A香港型やB型はほとんど変異しないことが分かっています。確認検査はA2009型インフルエンザウイルスで行っています。
■昨シーズン（2015年9月～2016年8月）は、18件の検査を実施しています。このうち
1件から薬剤耐性遺伝子が検出され、国立感染症研究所で薬剤感受性試験を行った結果、オセルタミビル（商品名タミフル）及びペラミビル（商品名ラピアクタ）に対して耐性を示すことが確認されました。
日本国内では、インフルエンザ治療薬として、主にオセルタミビル、ペラミビル、ザナミビル（商品名リレンザ）及びラニナミビル（商品名イナビル）の4薬剤が使用されていますが、これらすべてに耐性を示す変異ウイルスは、これまでに1例も検出されておりません。
インフルエンザウイルス タミフル耐性遺伝子検査（2015-16シーズン）PDFファイル：4KB
■2014-15シーズン（2014年9月～2015年8月）は、A2009型が検出されていませんので、タミフル耐性遺伝子検査は行っていません。
■2013-14シーズン（2013年9月～2014年8月）は、44件の検査を実施しました。そのうち、
1件のタミフル耐性ウイルスが確認されております。このウイルスは散発事例であり、この型のウイルスが、県内で流行することはありませんでした。詳しくは下のPDFファイルをご覧ください。
インフルエンザウイルス タミフル耐性遺伝子検査（2013-14シーズン）PDFファイル：4KB
■2012-13（2012年9月～2013年8月）は、3件の検査を実施しました。その結果、3件全てタミフル感受性でした。
■2011-12シーズン（2011年9月～2012年8月）は、A2009型が検出されていませんので、タミフル耐性遺伝子検査は行っていません。
■2010-11シーズン(2010年9月～2011年8月）は、41件の検査を実施しました。そのうち、
1件のタミフル耐性ウイルスが確認されております。このウイルスは散発事例であり、この型のウイルスが、県内で流行することはありませんでした。詳しくは下のPDFファイルをご覧ください。
インフルエンザウイルス タミフル耐性遺伝子検査（2010-11シーズン）PDFファイル：41KB
09-10シーズン（2009年9月～2010年8月）の結果は、下のPDFファイルをご覧ください。
インフルエンザウイルス タミフル耐性遺伝子検査（2009-10シーズン)PDFファイル：42KB